一个，位于安亭的上海虹桥动车运用所。
目前承担沪杭城际（湖苏浙皖）、沪宁城际（江鲁京冀）、青银高铁（京冀鲁陕甘宁新）以及沿海通道（辽吉黑冀)四个线路段列车到发、停放及检查、整备任务。 随着沪昆客专（赣湘黔滇）开通，未来还将增加负责该线段的动车组乘务工作。 目前上海局使用D301/2 D303/4 D305/6 D307/8 四列检动车负责上述四大干线的列车日常安全检查与出库试风工作，其中部分列车同时承担部分运营列车的重联任务。
未来还要新建的枢纽包括南通(苏中)和嘉兴北(浙江)两个枢纽，但据说是利用既有线改造不用新建，毕竟上海周边可开发的土地资源不多了。
须彤柔优质答主上海虹桥动车所
位于上海市虹桥站西侧，总占地面积42.15公顷(632.25亩)，建筑面积3868.75平方米，最高聚集存车能力52对，预留52对（总计104对）。检修生产能力6线12标准组/ 日，预留4线8标准组/ 日。为上行存车的检修所，京沪高速铁路、沪昆客运专线、沪宁高速铁路、沪杭高速铁路、宁安城际进入上海市区的动车组列车将主要在该所内存放。
上海南翔动车所
位于嘉定区南翔镇，距虹桥站约17公里，总占地面积26.39公顷（395.85亩），建筑面积4821.53平方米。最高聚集存车能力36对，检修生产能力4线8标准组/ 日，为上行存车的检修所，沪宁高速铁路进入市区的动车组列车（上海站）将主要在该所内存放。
上海东动车所
位于临港新片区中心，距浦东国际机场22公里，总占地面积30.30公顷（454.5 亩），建筑面积10200.58平方米，最高聚集存车能力36对，6线12标准组/日。为下行存车的检修所，沪通铁路、沪乍杭铁路、沪甬跨海铁路、沪舟甬跨海铁路、沪甬跨海铁路、沪甬跨海铁路进入市区的动车组列车将主要在该所内存放。
